Scanpy를 사용하여 클러스터링 시각화 및 세포 유형 주석에 대한 완전한 단일 세포 RNA 시퀀싱 분석 파이프라인 구축 코딩 가이드
이 튜토리얼에서는 Scanpy를 사용하여 단일 세포 RNA 시퀀싱 분석을 위한 완전한 파이프라인을 구축하는 방법을 안내합니다. 먼저 필요한 라이브러리를 설치하고 PBMC 3k 데이터세트를 로드합니다. 그런 다음 데이터를 다음 분석을 위해 준비하기 위해 품질 관리, 필터링 및 정규화를 수행합니다. 고변동 유전자를 식별하고 차원 축소를 위해 주성분 분석(PCA)를 수행한 후 클러스터링, 시각화 및 세포 유형 주석을 진행합니다. Scanpy를 사용하면 이러한 작업을 간단하게 수행할 수 있으며, 데이터의 구조와 특성을 더 잘 이해할 수 있습니다.
출처: Mark Tech Post
요약번역: 미주투데이 김지호 기자